連結決算、子会社S社の取得において、取得時にS社の時価評価の…

連結決算、子会社S社の取得において、取得時にS社の時価評価の有形固定資産に減価償却のもの（建物）がある場合の質問です。
年度が経って、有形固定資産の減価償却に伴い、評価差額の減額の仕訳（開始仕訳の中）は、利益剰余金期首残が減額されていますが、なぜ下記借方の利益剰余金期首残のところは評価差額ではないでしょうか。

（借方）利益剰余金期首残　（貸方）有形固定資産
（借方）非支配株主持分期首残　（貸方）利益剰余金期首残

S社資本勘定推移のテーブルは、利益剰余金と評価差額は別のものですが、評価差額の代わりに利益剰余金の相殺で計上しS社資本の合計額に影響がなくても、利益剰余金の計算はずれないでしょうか。